對于制藥用水的使用來說，理想的水系統(tǒng)應是恒定地產水和恒定量的用水，不加貯罐。系統(tǒng)制備多少水，工藝過程就即時地使用多少水。事實上，藥品生產的不同階段對工藝用水的種類、用水時間、水的溫度及數(shù)量各不相同，不可能恒定，生產的各種需要必然會造成用水高峰期，也會出現(xiàn)不消耗水的時間。因此，制藥用水的貯存方式成為工藝用水系統(tǒng)四大組成部分之一，即工藝用水的制備、貯存、分配輸送和微生物控制。
一、制藥用水分配系統(tǒng)的設計原則
在制藥工藝用水分配輸送系統(tǒng)的設計中，不僅應考慮到通過循環(huán)能夠使水在管道中連續(xù)不斷地流動，而且應該確保能夠定期對系統(tǒng)進行清洗，使之恢復到使用前的良好狀態(tài)。經驗表明，不斷循環(huán)的分配輸送系統(tǒng)容易維持系統(tǒng)內正常供水中微生物控制水平。
二、純化水的分配
純化水的分配輸送系統(tǒng)目前國內有兩種形式，一種是循環(huán)配水法，另一送水為非循環(huán)配水法，俗稱直流輸送法。
三、水系統(tǒng)的外源性污染
制藥用水系統(tǒng)的污染大體上可分為外源性污染和內源性污染兩種。外源性污染主要是指源水及系統(tǒng)外部因原所致的污染。源水的污染是制藥用水zui主要的外源性污染源。
四、水系統(tǒng)的內源性污染
內源性污染是指制藥用水系統(tǒng)運行過程中所致的污染。它與制水系統(tǒng)的設計、選材、運行、維護、貯存、分配等因素息息相關；與外源性污染也有十分密切的相關性。
五、特殊污染物—細菌內毒素
對制藥用水系統(tǒng)來說，革蘭氏陰性菌危害zui大，因為它很易形成生物膜并由此成為內毒素的污染源。水系統(tǒng)中形成菌落的生物膜釋放或者源水的污染均可成為水中游離態(tài)內毒素的污染源。
六、制藥用水系統(tǒng)的運行控制標準
⑴ 警戒水平：警戒水平是指微生物污染的某一水平，監(jiān)控結果超過它時表明制藥用水系統(tǒng)有偏離正常運行條件的趨勢。警戒水平的含義是報警，通常屬企業(yè)的內控標準，尚不要求采取特別的糾偏措施。
⑵ 糾偏限度：糾偏限度是指微生物污染的某一限度，監(jiān)控結果超過此限度時，表明制藥用水系統(tǒng)已經較為嚴重地偏離了正常的運行條件應當采取糾偏措施，使系統(tǒng)回到正常的運行狀態(tài)。
警戒水平和糾偏限度可以理解為制藥用水系統(tǒng)的“運行控制標準”。與產品質量標準不同，僅用于系統(tǒng)的監(jiān)控，而不是用以判斷產品的合格或不合格，超出警戒水平和糾偏限度時，并不意味著產品已出現(xiàn)質量問題，因為標準設定已經考慮了產品的安全因素。
